Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES6

MFSD3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD3Q96ES6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MFSD3Q96ES6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms