Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NMD3Q96D46 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms