Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG3

TIFA, TRAF-interacting protein with FHA domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIFAQ96CG3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TIFAQ96CG3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TIFAQ96CG3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TIFAQ96CG3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TIFAQ96CG3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TIFAQ96CG3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TIFAQ96CG3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TIFAQ96CG3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TIFAQ96CG3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TIFAQ96CG3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TIFAQ96CG3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TIFAQ96CG3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TIFAQ96CG3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TIFAQ96CG3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TIFAQ96CG3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TIFAQ96CG3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TIFAQ96CG3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TIFAQ96CG3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TIFAQ96CG3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TIFAQ96CG3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TIFAQ96CG3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TIFAQ96CG3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TIFAQ96CG3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TIFAQ96CG3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TIFAQ96CG3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TIFAQ96CG3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TIFAQ96CG3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TIFAQ96CG3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TIFAQ96CG3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TIFAQ96CG3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TIFAQ96CG3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TIFAQ96CG3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TIFAQ96CG3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TIFAQ96CG3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TIFAQ96CG3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TIFAQ96CG3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TIFAQ96CG3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TIFAQ96CG3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TIFAQ96CG3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TIFAQ96CG3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TIFAQ96CG3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TIFAQ96CG3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TIFAQ96CG3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TIFAQ96CG3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TIFAQ96CG3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TIFAQ96CG3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TIFAQ96CG3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TIFAQ96CG3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TIFAQ96CG3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TIFAQ96CG3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TIFAQ96CG3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TIFAQ96CG3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TIFAQ96CG3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TIFAQ96CG3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TIFAQ96CG3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TIFAQ96CG3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TIFAQ96CG3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TIFAQ96CG3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TIFAQ96CG3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TIFAQ96CG3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TIFAQ96CG3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TIFAQ96CG3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TIFAQ96CG3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TIFAQ96CG3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TIFAQ96CG3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TIFAQ96CG3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TIFAQ96CG3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TIFAQ96CG3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TIFAQ96CG3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TIFAQ96CG3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TIFAQ96CG3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TIFAQ96CG3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TIFAQ96CG3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TIFAQ96CG3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TIFAQ96CG3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TIFAQ96CG3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TIFAQ96CG3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms