Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY2

EME1, Crossover junction endonuclease EME1, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME1Q96AY2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EME1Q96AY2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EME1Q96AY2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EME1Q96AY2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EME1Q96AY2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EME1Q96AY2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EME1Q96AY2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EME1Q96AY2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EME1Q96AY2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EME1Q96AY2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EME1Q96AY2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EME1Q96AY2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EME1Q96AY2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EME1Q96AY2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EME1Q96AY2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EME1Q96AY2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EME1Q96AY2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EME1Q96AY2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EME1Q96AY2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EME1Q96AY2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EME1Q96AY2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EME1Q96AY2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EME1Q96AY2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EME1Q96AY2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
EME1Q96AY2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EME1Q96AY2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EME1Q96AY2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EME1Q96AY2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EME1Q96AY2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EME1Q96AY2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms