Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VTI1AQ96AJ9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VTI1AQ96AJ9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms