Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF34Q969K3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF34Q969K3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms