Protein–RNA interactions for Protein: Q92611

EDEM1, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM1Q92611 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EDEM1Q92611 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDEM1Q92611 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDEM1Q92611 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms