Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF7

ATL1, Atlastin-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL1Q8WXF7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATL1Q8WXF7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms