Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF0

SRSF12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF12Q8WXF0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SRSF12Q8WXF0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms