Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVY7

UBLCP1, Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBLCP1Q8WVY7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBLCP1Q8WVY7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBLCP1Q8WVY7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms