Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.64■■■■■ 4.42
RB1CC1Q8TDY2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
RB1CC1Q8TDY2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
RB1CC1Q8TDY2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC42.64■■■■■ 4.42
RB1CC1Q8TDY2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
RB1CC1Q8TDY2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
RB1CC1Q8TDY2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
RB1CC1Q8TDY2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
RB1CC1Q8TDY2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC42.63■■■■■ 4.41
RB1CC1Q8TDY2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
RB1CC1Q8TDY2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC42.63■■■■■ 4.41
RB1CC1Q8TDY2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
RB1CC1Q8TDY2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
RB1CC1Q8TDY2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC42.62■■■■■ 4.41
RB1CC1Q8TDY2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.62■■■■■ 4.41
RB1CC1Q8TDY2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
RB1CC1Q8TDY2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC42.62■■■■■ 4.41
RB1CC1Q8TDY2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.61■■■■■ 4.41
RB1CC1Q8TDY2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
RB1CC1Q8TDY2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
RB1CC1Q8TDY2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.61■■■■■ 4.41
RB1CC1Q8TDY2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC42.6■■■■■ 4.41
RB1CC1Q8TDY2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC42.6■■■■■ 4.41
RB1CC1Q8TDY2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
RB1CC1Q8TDY2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC42.6■■■■■ 4.41
RB1CC1Q8TDY2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
RB1CC1Q8TDY2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
RB1CC1Q8TDY2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
RB1CC1Q8TDY2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
RB1CC1Q8TDY2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC42.59■■■■■ 4.41
RB1CC1Q8TDY2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
RB1CC1Q8TDY2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
RB1CC1Q8TDY2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC42.59■■■■■ 4.41
RB1CC1Q8TDY2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC42.59■■■■■ 4.41
RB1CC1Q8TDY2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC42.59■■■■■ 4.41
RB1CC1Q8TDY2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
RB1CC1Q8TDY2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
RB1CC1Q8TDY2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC42.58■■■■■ 4.41
RB1CC1Q8TDY2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.58■■■■■ 4.41
RB1CC1Q8TDY2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
RB1CC1Q8TDY2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC42.58■■■■■ 4.41
RB1CC1Q8TDY2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC42.58■■■■■ 4.41
RB1CC1Q8TDY2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
RB1CC1Q8TDY2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
RB1CC1Q8TDY2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
RB1CC1Q8TDY2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC42.57■■■■■ 4.41
RB1CC1Q8TDY2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
RB1CC1Q8TDY2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
RB1CC1Q8TDY2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
RB1CC1Q8TDY2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC42.56■■■■■ 4.4
RB1CC1Q8TDY2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC42.56■■■■■ 4.4
RB1CC1Q8TDY2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC42.56■■■■■ 4.4
RB1CC1Q8TDY2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
RB1CC1Q8TDY2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
RB1CC1Q8TDY2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
RB1CC1Q8TDY2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC42.56■■■■■ 4.4
RB1CC1Q8TDY2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC42.56■■■■■ 4.4
RB1CC1Q8TDY2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC42.56■■■■■ 4.4
RB1CC1Q8TDY2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
RB1CC1Q8TDY2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC42.56■■■■■ 4.4
RB1CC1Q8TDY2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC42.56■■■■■ 4.4
RB1CC1Q8TDY2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
RB1CC1Q8TDY2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
RB1CC1Q8TDY2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC42.55■■■■■ 4.4
RB1CC1Q8TDY2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC42.55■■■■■ 4.4
RB1CC1Q8TDY2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC42.55■■■■■ 4.4
RB1CC1Q8TDY2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC42.55■■■■■ 4.4
RB1CC1Q8TDY2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
RB1CC1Q8TDY2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
RB1CC1Q8TDY2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC42.54■■■■■ 4.4
RB1CC1Q8TDY2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
RB1CC1Q8TDY2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC42.54■■■■■ 4.4
RB1CC1Q8TDY2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC42.54■■■■■ 4.4
RB1CC1Q8TDY2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
RB1CC1Q8TDY2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
RB1CC1Q8TDY2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC42.53■■■■■ 4.4
RB1CC1Q8TDY2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.53■■■■■ 4.4
RB1CC1Q8TDY2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
RB1CC1Q8TDY2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
RB1CC1Q8TDY2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
RB1CC1Q8TDY2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC42.52■■■■■ 4.4
RB1CC1Q8TDY2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
RB1CC1Q8TDY2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
RB1CC1Q8TDY2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.51■■■■■ 4.4
RB1CC1Q8TDY2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
RB1CC1Q8TDY2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC42.51■■■■■ 4.4
RB1CC1Q8TDY2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC42.51■■■■■ 4.4
RB1CC1Q8TDY2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.51■■■■■ 4.4
RB1CC1Q8TDY2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC42.51■■■■■ 4.4
RB1CC1Q8TDY2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
RB1CC1Q8TDY2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC42.51■■■■■ 4.4
RB1CC1Q8TDY2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
RB1CC1Q8TDY2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
RB1CC1Q8TDY2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
RB1CC1Q8TDY2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC42.5■■■■■ 4.39
RB1CC1Q8TDY2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC42.5■■■■■ 4.39
RB1CC1Q8TDY2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC42.5■■■■■ 4.39
RB1CC1Q8TDY2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
RB1CC1Q8TDY2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC42.5■■■■■ 4.39
RB1CC1Q8TDY2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.7 ms