Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHU2

CFAP61, Cilia- and flagella-associated protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP61Q8NHU2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP61Q8NHU2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP61Q8NHU2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CFAP61Q8NHU2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CFAP61Q8NHU2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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