Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BEST4Q8NFU0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BEST4Q8NFU0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BEST4Q8NFU0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BEST4Q8NFU0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BEST4Q8NFU0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BEST4Q8NFU0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BEST4Q8NFU0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BEST4Q8NFU0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
BEST4Q8NFU0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BEST4Q8NFU0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BEST4Q8NFU0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BEST4Q8NFU0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BEST4Q8NFU0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BEST4Q8NFU0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BEST4Q8NFU0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BEST4Q8NFU0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BEST4Q8NFU0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BEST4Q8NFU0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
BEST4Q8NFU0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BEST4Q8NFU0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BEST4Q8NFU0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BEST4Q8NFU0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BEST4Q8NFU0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BEST4Q8NFU0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BEST4Q8NFU0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.2 ms