Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ZNF548Q8NEK5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF548Q8NEK5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
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