Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PNLDC1Q8NA58 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PNLDC1Q8NA58 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms