Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNAAF3Q8N9W5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAAF3Q8N9W5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms