Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SFRP1Q8N474 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFRP1Q8N474 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFRP1Q8N474 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFRP1Q8N474 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFRP1Q8N474 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFRP1Q8N474 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFRP1Q8N474 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFRP1Q8N474 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFRP1Q8N474 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFRP1Q8N474 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFRP1Q8N474 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFRP1Q8N474 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFRP1Q8N474 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFRP1Q8N474 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFRP1Q8N474 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFRP1Q8N474 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFRP1Q8N474 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFRP1Q8N474 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFRP1Q8N474 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFRP1Q8N474 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFRP1Q8N474 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFRP1Q8N474 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFRP1Q8N474 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFRP1Q8N474 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFRP1Q8N474 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFRP1Q8N474 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFRP1Q8N474 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFRP1Q8N474 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFRP1Q8N474 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFRP1Q8N474 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFRP1Q8N474 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFRP1Q8N474 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFRP1Q8N474 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFRP1Q8N474 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFRP1Q8N474 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFRP1Q8N474 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFRP1Q8N474 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFRP1Q8N474 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFRP1Q8N474 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFRP1Q8N474 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFRP1Q8N474 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFRP1Q8N474 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SFRP1Q8N474 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFRP1Q8N474 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFRP1Q8N474 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFRP1Q8N474 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFRP1Q8N474 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFRP1Q8N474 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFRP1Q8N474 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFRP1Q8N474 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFRP1Q8N474 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SFRP1Q8N474 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFRP1Q8N474 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SFRP1Q8N474 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFRP1Q8N474 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFRP1Q8N474 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFRP1Q8N474 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFRP1Q8N474 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SFRP1Q8N474 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFRP1Q8N474 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFRP1Q8N474 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFRP1Q8N474 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFRP1Q8N474 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFRP1Q8N474 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFRP1Q8N474 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFRP1Q8N474 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms