Protein–RNA interactions for Protein: Q8N271

PROM2, Prominin-2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2Q8N271 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PROM2Q8N271 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PROM2Q8N271 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PROM2Q8N271 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PROM2Q8N271 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PROM2Q8N271 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PROM2Q8N271 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PROM2Q8N271 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PROM2Q8N271 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PROM2Q8N271 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PROM2Q8N271 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PROM2Q8N271 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PROM2Q8N271 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PROM2Q8N271 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PROM2Q8N271 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PROM2Q8N271 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PROM2Q8N271 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PROM2Q8N271 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PROM2Q8N271 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PROM2Q8N271 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PROM2Q8N271 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PROM2Q8N271 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PROM2Q8N271 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PROM2Q8N271 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PROM2Q8N271 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PROM2Q8N271 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PROM2Q8N271 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PROM2Q8N271 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PROM2Q8N271 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PROM2Q8N271 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PROM2Q8N271 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PROM2Q8N271 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PROM2Q8N271 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PROM2Q8N271 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PROM2Q8N271 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PROM2Q8N271 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PROM2Q8N271 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PROM2Q8N271 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PROM2Q8N271 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PROM2Q8N271 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PROM2Q8N271 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PROM2Q8N271 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PROM2Q8N271 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PROM2Q8N271 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PROM2Q8N271 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PROM2Q8N271 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PROM2Q8N271 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PROM2Q8N271 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PROM2Q8N271 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PROM2Q8N271 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PROM2Q8N271 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PROM2Q8N271 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PROM2Q8N271 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PROM2Q8N271 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PROM2Q8N271 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PROM2Q8N271 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PROM2Q8N271 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PROM2Q8N271 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PROM2Q8N271 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PROM2Q8N271 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PROM2Q8N271 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PROM2Q8N271 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PROM2Q8N271 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PROM2Q8N271 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PROM2Q8N271 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PROM2Q8N271 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PROM2Q8N271 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PROM2Q8N271 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PROM2Q8N271 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PROM2Q8N271 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PROM2Q8N271 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PROM2Q8N271 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PROM2Q8N271 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PROM2Q8N271 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PROM2Q8N271 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PROM2Q8N271 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PROM2Q8N271 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PROM2Q8N271 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PROM2Q8N271 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PROM2Q8N271 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PROM2Q8N271 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PROM2Q8N271 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PROM2Q8N271 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PROM2Q8N271 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PROM2Q8N271 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PROM2Q8N271 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PROM2Q8N271 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PROM2Q8N271 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PROM2Q8N271 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PROM2Q8N271 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PROM2Q8N271 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PROM2Q8N271 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PROM2Q8N271 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PROM2Q8N271 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PROM2Q8N271 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PROM2Q8N271 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PROM2Q8N271 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PROM2Q8N271 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PROM2Q8N271 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PROM2Q8N271 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms