Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Z9

VSIG10, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG10Q8N0Z9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VSIG10Q8N0Z9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VSIG10Q8N0Z9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VSIG10Q8N0Z9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VSIG10Q8N0Z9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VSIG10Q8N0Z9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VSIG10Q8N0Z9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VSIG10Q8N0Z9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VSIG10Q8N0Z9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
VSIG10Q8N0Z9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VSIG10Q8N0Z9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
VSIG10Q8N0Z9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VSIG10Q8N0Z9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VSIG10Q8N0Z9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
VSIG10Q8N0Z9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
VSIG10Q8N0Z9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
VSIG10Q8N0Z9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
VSIG10Q8N0Z9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
VSIG10Q8N0Z9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VSIG10Q8N0Z9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VSIG10Q8N0Z9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VSIG10Q8N0Z9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VSIG10Q8N0Z9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VSIG10Q8N0Z9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VSIG10Q8N0Z9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
VSIG10Q8N0Z9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
VSIG10Q8N0Z9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VSIG10Q8N0Z9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VSIG10Q8N0Z9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VSIG10Q8N0Z9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VSIG10Q8N0Z9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VSIG10Q8N0Z9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VSIG10Q8N0Z9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VSIG10Q8N0Z9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VSIG10Q8N0Z9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VSIG10Q8N0Z9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VSIG10Q8N0Z9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VSIG10Q8N0Z9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VSIG10Q8N0Z9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VSIG10Q8N0Z9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VSIG10Q8N0Z9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
VSIG10Q8N0Z9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
VSIG10Q8N0Z9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
VSIG10Q8N0Z9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
VSIG10Q8N0Z9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
VSIG10Q8N0Z9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
VSIG10Q8N0Z9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
VSIG10Q8N0Z9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VSIG10Q8N0Z9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VSIG10Q8N0Z9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VSIG10Q8N0Z9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
VSIG10Q8N0Z9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
VSIG10Q8N0Z9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VSIG10Q8N0Z9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VSIG10Q8N0Z9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VSIG10Q8N0Z9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VSIG10Q8N0Z9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VSIG10Q8N0Z9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VSIG10Q8N0Z9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VSIG10Q8N0Z9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VSIG10Q8N0Z9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VSIG10Q8N0Z9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VSIG10Q8N0Z9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VSIG10Q8N0Z9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VSIG10Q8N0Z9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VSIG10Q8N0Z9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VSIG10Q8N0Z9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VSIG10Q8N0Z9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VSIG10Q8N0Z9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VSIG10Q8N0Z9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VSIG10Q8N0Z9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VSIG10Q8N0Z9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VSIG10Q8N0Z9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VSIG10Q8N0Z9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VSIG10Q8N0Z9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
VSIG10Q8N0Z9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
VSIG10Q8N0Z9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VSIG10Q8N0Z9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VSIG10Q8N0Z9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VSIG10Q8N0Z9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VSIG10Q8N0Z9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VSIG10Q8N0Z9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VSIG10Q8N0Z9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VSIG10Q8N0Z9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VSIG10Q8N0Z9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VSIG10Q8N0Z9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VSIG10Q8N0Z9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VSIG10Q8N0Z9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VSIG10Q8N0Z9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VSIG10Q8N0Z9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VSIG10Q8N0Z9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VSIG10Q8N0Z9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VSIG10Q8N0Z9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VSIG10Q8N0Z9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
VSIG10Q8N0Z9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VSIG10Q8N0Z9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
VSIG10Q8N0Z9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
VSIG10Q8N0Z9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
VSIG10Q8N0Z9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
VSIG10Q8N0Z9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms