Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCP3Q8IZU3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCP3Q8IZU3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms