Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZM8

ZNF654, Zinc finger protein 654, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF654Q8IZM8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF654Q8IZM8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF654Q8IZM8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF654Q8IZM8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF654Q8IZM8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF654Q8IZM8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF654Q8IZM8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF654Q8IZM8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF654Q8IZM8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF654Q8IZM8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF654Q8IZM8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF654Q8IZM8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF654Q8IZM8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF654Q8IZM8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF654Q8IZM8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF654Q8IZM8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF654Q8IZM8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF654Q8IZM8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF654Q8IZM8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF654Q8IZM8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF654Q8IZM8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF654Q8IZM8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF654Q8IZM8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF654Q8IZM8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF654Q8IZM8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF654Q8IZM8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF654Q8IZM8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF654Q8IZM8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF654Q8IZM8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF654Q8IZM8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF654Q8IZM8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF654Q8IZM8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF654Q8IZM8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF654Q8IZM8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF654Q8IZM8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF654Q8IZM8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF654Q8IZM8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF654Q8IZM8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF654Q8IZM8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF654Q8IZM8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF654Q8IZM8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF654Q8IZM8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF654Q8IZM8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF654Q8IZM8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF654Q8IZM8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF654Q8IZM8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF654Q8IZM8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF654Q8IZM8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF654Q8IZM8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF654Q8IZM8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF654Q8IZM8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF654Q8IZM8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF654Q8IZM8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF654Q8IZM8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF654Q8IZM8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF654Q8IZM8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF654Q8IZM8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF654Q8IZM8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF654Q8IZM8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF654Q8IZM8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ZNF654Q8IZM8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ZNF654Q8IZM8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ZNF654Q8IZM8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ZNF654Q8IZM8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF654Q8IZM8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF654Q8IZM8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF654Q8IZM8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF654Q8IZM8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF654Q8IZM8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF654Q8IZM8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF654Q8IZM8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF654Q8IZM8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF654Q8IZM8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF654Q8IZM8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF654Q8IZM8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF654Q8IZM8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF654Q8IZM8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF654Q8IZM8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF654Q8IZM8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF654Q8IZM8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF654Q8IZM8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF654Q8IZM8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF654Q8IZM8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF654Q8IZM8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF654Q8IZM8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF654Q8IZM8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF654Q8IZM8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF654Q8IZM8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF654Q8IZM8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF654Q8IZM8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF654Q8IZM8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF654Q8IZM8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF654Q8IZM8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF654Q8IZM8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF654Q8IZM8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF654Q8IZM8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF654Q8IZM8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF654Q8IZM8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF654Q8IZM8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF654Q8IZM8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms