Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RPAP2Q8IXW5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPAP2Q8IXW5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms