Protein–RNA interactions for Protein: Q86YP4

GATAD2A, Transcriptional repressor p66-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2AQ86YP4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GATAD2AQ86YP4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GATAD2AQ86YP4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GATAD2AQ86YP4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATAD2AQ86YP4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATAD2AQ86YP4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATAD2AQ86YP4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATAD2AQ86YP4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATAD2AQ86YP4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATAD2AQ86YP4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATAD2AQ86YP4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATAD2AQ86YP4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATAD2AQ86YP4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATAD2AQ86YP4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATAD2AQ86YP4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATAD2AQ86YP4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATAD2AQ86YP4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GATAD2AQ86YP4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GATAD2AQ86YP4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GATAD2AQ86YP4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GATAD2AQ86YP4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GATAD2AQ86YP4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GATAD2AQ86YP4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GATAD2AQ86YP4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GATAD2AQ86YP4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GATAD2AQ86YP4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GATAD2AQ86YP4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GATAD2AQ86YP4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GATAD2AQ86YP4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GATAD2AQ86YP4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GATAD2AQ86YP4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GATAD2AQ86YP4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GATAD2AQ86YP4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms