Protein–RNA interactions for Protein: Q86VP3

PACS2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, humanhuman

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS2Q86VP3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PACS2Q86VP3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PACS2Q86VP3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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