Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KRT27Q7Z3Y8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KRT27Q7Z3Y8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KRT27Q7Z3Y8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KRT27Q7Z3Y8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
KRT27Q7Z3Y8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KRT27Q7Z3Y8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KRT27Q7Z3Y8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KRT27Q7Z3Y8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KRT27Q7Z3Y8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KRT27Q7Z3Y8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KRT27Q7Z3Y8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KRT27Q7Z3Y8 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KRT27Q7Z3Y8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KRT27Q7Z3Y8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KRT27Q7Z3Y8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
KRT27Q7Z3Y8 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
KRT27Q7Z3Y8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KRT27Q7Z3Y8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
KRT27Q7Z3Y8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KRT27Q7Z3Y8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KRT27Q7Z3Y8 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KRT27Q7Z3Y8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KRT27Q7Z3Y8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
KRT27Q7Z3Y8 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KRT27Q7Z3Y8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KRT27Q7Z3Y8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KRT27Q7Z3Y8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KRT27Q7Z3Y8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT27Q7Z3Y8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT27Q7Z3Y8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT27Q7Z3Y8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT27Q7Z3Y8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT27Q7Z3Y8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT27Q7Z3Y8 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT27Q7Z3Y8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT27Q7Z3Y8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT27Q7Z3Y8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT27Q7Z3Y8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KRT27Q7Z3Y8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KRT27Q7Z3Y8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KRT27Q7Z3Y8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KRT27Q7Z3Y8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KRT27Q7Z3Y8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
KRT27Q7Z3Y8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KRT27Q7Z3Y8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KRT27Q7Z3Y8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KRT27Q7Z3Y8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KRT27Q7Z3Y8 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KRT27Q7Z3Y8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KRT27Q7Z3Y8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
KRT27Q7Z3Y8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KRT27Q7Z3Y8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KRT27Q7Z3Y8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KRT27Q7Z3Y8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KRT27Q7Z3Y8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
KRT27Q7Z3Y8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
KRT27Q7Z3Y8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KRT27Q7Z3Y8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KRT27Q7Z3Y8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KRT27Q7Z3Y8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KRT27Q7Z3Y8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KRT27Q7Z3Y8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KRT27Q7Z3Y8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KRT27Q7Z3Y8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KRT27Q7Z3Y8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KRT27Q7Z3Y8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KRT27Q7Z3Y8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KRT27Q7Z3Y8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KRT27Q7Z3Y8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KRT27Q7Z3Y8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
KRT27Q7Z3Y8 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KRT27Q7Z3Y8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KRT27Q7Z3Y8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KRT27Q7Z3Y8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
KRT27Q7Z3Y8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KRT27Q7Z3Y8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KRT27Q7Z3Y8 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KRT27Q7Z3Y8 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
KRT27Q7Z3Y8 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
KRT27Q7Z3Y8 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KRT27Q7Z3Y8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KRT27Q7Z3Y8 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KRT27Q7Z3Y8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KRT27Q7Z3Y8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KRT27Q7Z3Y8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KRT27Q7Z3Y8 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KRT27Q7Z3Y8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KRT27Q7Z3Y8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KRT27Q7Z3Y8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KRT27Q7Z3Y8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KRT27Q7Z3Y8 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
KRT27Q7Z3Y8 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KRT27Q7Z3Y8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KRT27Q7Z3Y8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KRT27Q7Z3Y8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KRT27Q7Z3Y8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KRT27Q7Z3Y8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KRT27Q7Z3Y8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KRT27Q7Z3Y8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms