Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NLRP9Q7RTR0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NLRP9Q7RTR0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms