Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HS2ST1Q7LGA3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HS2ST1Q7LGA3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HS2ST1Q7LGA3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HS2ST1Q7LGA3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HS2ST1Q7LGA3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HS2ST1Q7LGA3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HS2ST1Q7LGA3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HS2ST1Q7LGA3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HS2ST1Q7LGA3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HS2ST1Q7LGA3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HS2ST1Q7LGA3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HS2ST1Q7LGA3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HS2ST1Q7LGA3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HS2ST1Q7LGA3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HS2ST1Q7LGA3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HS2ST1Q7LGA3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HS2ST1Q7LGA3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HS2ST1Q7LGA3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HS2ST1Q7LGA3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HS2ST1Q7LGA3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HS2ST1Q7LGA3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HS2ST1Q7LGA3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HS2ST1Q7LGA3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HS2ST1Q7LGA3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HS2ST1Q7LGA3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HS2ST1Q7LGA3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HS2ST1Q7LGA3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HS2ST1Q7LGA3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HS2ST1Q7LGA3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HS2ST1Q7LGA3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HS2ST1Q7LGA3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HS2ST1Q7LGA3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HS2ST1Q7LGA3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HS2ST1Q7LGA3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HS2ST1Q7LGA3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HS2ST1Q7LGA3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HS2ST1Q7LGA3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HS2ST1Q7LGA3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HS2ST1Q7LGA3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HS2ST1Q7LGA3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HS2ST1Q7LGA3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HS2ST1Q7LGA3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HS2ST1Q7LGA3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HS2ST1Q7LGA3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HS2ST1Q7LGA3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HS2ST1Q7LGA3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HS2ST1Q7LGA3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HS2ST1Q7LGA3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HS2ST1Q7LGA3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HS2ST1Q7LGA3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HS2ST1Q7LGA3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HS2ST1Q7LGA3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HS2ST1Q7LGA3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HS2ST1Q7LGA3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HS2ST1Q7LGA3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms