Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5N7

LPCAT2, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT2Q7L5N7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LPCAT2Q7L5N7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LPCAT2Q7L5N7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms