Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1I2

SV2B, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2BQ7L1I2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SV2BQ7L1I2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SV2BQ7L1I2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms