Protein–RNA interactions for Protein: Q7KZF4

SND1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SND1Q7KZF4 TSPAN6-201ENST00000373020 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.215e-7■■■■□ 21.5
SND1Q7KZF4 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.465e-7■■■■□ 21.5
SND1Q7KZF4 TNFRSF10B-205ENST00000519910 546 ntTSL 414.19□□□□□ -0.143e-7■■■■□ 21.5
SND1Q7KZF4 ATP6AP1-206ENST00000449556 720 ntTSL 523.6■■□□□ 1.376e-11■■■■□ 21.5
SND1Q7KZF4 HSPA13-202ENST00000478035 620 ntTSL 315.24■□□□□ 0.032e-6■■■■□ 21.5
SND1Q7KZF4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.192e-10■■■■□ 21.5
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SND1Q7KZF4 C8A-201ENST00000361249 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.492e-6■■■■□ 21.5
SND1Q7KZF4 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.394e-10■■■■□ 21.5
SND1Q7KZF4 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.284e-10■■■■□ 21.5
SND1Q7KZF4 B2M-211ENST00000561139 717 ntTSL 38.59□□□□□ -1.033e-16■■■■□ 21.5
SND1Q7KZF4 KRT18-203ENST00000546656 521 ntTSL 214.38□□□□□ -0.112e-12■■■■□ 21.5
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SND1Q7KZF4 KIAA0319L-217ENST00000485551 4398 ntTSL 28.02□□□□□ -1.131e-6■■■■□ 21.5
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SND1Q7KZF4 LEPR-203ENST00000371058 2805 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.071e-6■■■■□ 21.5
SND1Q7KZF4 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.391e-6■■■■□ 21.5
SND1Q7KZF4 TMEM59-201ENST00000234831 6691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.282e-7■■■■□ 21.5
SND1Q7KZF4 TMEM59-203ENST00000371341 1116 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.842e-7■■■■□ 21.5
SND1Q7KZF4 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.562e-7■■■■□ 21.5
SND1Q7KZF4 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.562e-6■■■■□ 21.5
SND1Q7KZF4 DHRS7B-201ENST00000346603 1567 ntTSL 1 (best)17.36■□□□□ 0.372e-6■■■■□ 21.5
SND1Q7KZF4 DHRS7B-204ENST00000578426 998 ntTSL 315.7■□□□□ 0.12e-6■■■■□ 21.5
SND1Q7KZF4 DHRS7B-202ENST00000395511 2175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.092e-6■■■■□ 21.5
SND1Q7KZF4 COX7A2-203ENST00000377978 366 ntTSL 59.12□□□□□ -0.952e-9■■■■□ 21.5
SND1Q7KZF4 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.982e-21■■■■□ 21.5
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SND1Q7KZF4 SARAF-210ENST00000522055 582 ntTSL 321.93■■□□□ 1.13e-9■■■■□ 21.5
SND1Q7KZF4 HEXA-216ENST00000569509 590 ntTSL 410.91□□□□□ -0.662e-7■■■■□ 21.4
SND1Q7KZF4 CD151-205ENST00000525181 364 ntTSL 39.26□□□□□ -0.933e-18■■■■□ 21.4
SND1Q7KZF4 FGL1-210ENST00000522636 773 ntTSL 26.84□□□□□ -1.313e-20■■■■□ 21.4
SND1Q7KZF4 BCAP31-202ENST00000416815 688 ntTSL 519.12■□□□□ 0.653e-15■■■■□ 21.4
SND1Q7KZF4 BCAP31-203ENST00000423827 669 ntTSL 515.74■□□□□ 0.113e-15■■■■□ 21.4
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SND1Q7KZF4 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.574e-9■■■■□ 21.4
SND1Q7KZF4 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.414e-9■■■■□ 21.4
SND1Q7KZF4 CCT6A-207ENST00000492618 692 ntTSL 311□□□□□ -0.654e-9■■■■□ 21.4
SND1Q7KZF4 TMX3-201ENST00000299608 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.545e-7■■■■□ 21.4
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SND1Q7KZF4 QSOX1-204ENST00000443059 893 ntTSL 215.14■□□□□ 0.011e-7■■■■□ 21.4
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SND1Q7KZF4 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.172e-8■■■■□ 21.4
SND1Q7KZF4 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.032e-8■■■■□ 21.4
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SND1Q7KZF4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.562e-9■■■■□ 21.4
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SND1Q7KZF4 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.064e-10■■■■□ 21.4
SND1Q7KZF4 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.134e-10■■■■□ 21.4
SND1Q7KZF4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.294e-6■■■■□ 21.4
SND1Q7KZF4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.94e-6■■■■□ 21.4
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SND1Q7KZF4 RETSAT-201ENST00000295802 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.683e-9■■■■□ 21.4
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SND1Q7KZF4 SERPINA6-201ENST00000341584 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.141e-7■■■■□ 21.4
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SND1Q7KZF4 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.033e-7■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 CTSB-210ENST00000526195 560 ntTSL 416.65■□□□□ 0.265e-34■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 CTSB-208ENST00000525076 550 ntTSL 515.72■□□□□ 0.115e-34■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 CTSB-230ENST00000534149 524 ntTSL 415.47■□□□□ 0.075e-34■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 CTSB-214ENST00000527243 580 ntTSL 411.56□□□□□ -0.565e-34■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 CTSB-212ENST00000526645 559 ntTSL 411.24□□□□□ -0.615e-34■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 LMAN1-204ENST00000587940 442 ntTSL 25.24□□□□□ -1.574e-7■■■■□ 21.3
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SND1Q7KZF4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.471e-10■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.471e-10■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 ST7-215ENST00000438863 1005 ntTSL 527.49■■□□□ 1.991e-10■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.671e-10■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.371e-10■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.061e-10■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.721e-10■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.531e-10■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.421e-10■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.381e-10■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 SCP2-203ENST00000371514 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.091e-10■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 ST7-226ENST00000487459 1681 ntTSL 514.39□□□□□ -0.111e-10■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 SCP2-210ENST00000478631 5204 ntTSL 213.35□□□□□ -0.271e-10■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 SCP2-209ENST00000478274 969 ntTSL 211.58□□□□□ -0.561e-10■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 ST7-223ENST00000467538 565 ntTSL 511.39□□□□□ -0.591e-10■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.721e-10■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 TPST2-206ENST00000445720 675 ntTSL 29.41□□□□□ -0.91e-10■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 ST7-216ENST00000443979 805 ntTSL 59.35□□□□□ -0.911e-10■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 ST7-210ENST00000420755 549 ntTSL 59.08□□□□□ -0.961e-10■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 SCP2-207ENST00000435345 894 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.021e-10■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 ST7-217ENST00000446490 1694 ntTSL 58.56□□□□□ -1.041e-10■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 ST7-227ENST00000489293 904 ntTSL 1 (best)8.38□□□□□ -1.071e-10■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 ST7-206ENST00000393447 2182 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.111e-10■■■■□ 21.3
SND1Q7KZF4 ST7-213ENST00000432298 1956 ntTSL 2 BASIC8.11□□□□□ -1.111e-10■■■■□ 21.3
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