Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUF6

LINC00336, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00336, humanhuman

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00336Q6ZUF6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00336Q6ZUF6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00336Q6ZUF6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00336Q6ZUF6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00336Q6ZUF6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00336Q6ZUF6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00336Q6ZUF6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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LINC00336Q6ZUF6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00336Q6ZUF6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00336Q6ZUF6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00336Q6ZUF6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00336Q6ZUF6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00336Q6ZUF6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00336Q6ZUF6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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LINC00336Q6ZUF6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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LINC00336Q6ZUF6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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LINC00336Q6ZUF6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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LINC00336Q6ZUF6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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LINC00336Q6ZUF6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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LINC00336Q6ZUF6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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LINC00336Q6ZUF6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00336Q6ZUF6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00336Q6ZUF6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00336Q6ZUF6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00336Q6ZUF6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00336Q6ZUF6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00336Q6ZUF6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00336Q6ZUF6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00336Q6ZUF6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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LINC00336Q6ZUF6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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