Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR5

TMEM136, Transmembrane protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM136Q6ZRR5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM136Q6ZRR5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM136Q6ZRR5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms