Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN66

GBP6, Guanylate-binding protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP6Q6ZN66 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GBP6Q6ZN66 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GBP6Q6ZN66 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GBP6Q6ZN66 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GBP6Q6ZN66 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GBP6Q6ZN66 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GBP6Q6ZN66 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GBP6Q6ZN66 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GBP6Q6ZN66 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GBP6Q6ZN66 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GBP6Q6ZN66 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GBP6Q6ZN66 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GBP6Q6ZN66 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GBP6Q6ZN66 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GBP6Q6ZN66 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GBP6Q6ZN66 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GBP6Q6ZN66 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GBP6Q6ZN66 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GBP6Q6ZN66 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GBP6Q6ZN66 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GBP6Q6ZN66 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GBP6Q6ZN66 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GBP6Q6ZN66 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GBP6Q6ZN66 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GBP6Q6ZN66 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GBP6Q6ZN66 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GBP6Q6ZN66 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GBP6Q6ZN66 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GBP6Q6ZN66 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GBP6Q6ZN66 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GBP6Q6ZN66 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GBP6Q6ZN66 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GBP6Q6ZN66 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GBP6Q6ZN66 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP6Q6ZN66 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP6Q6ZN66 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP6Q6ZN66 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP6Q6ZN66 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP6Q6ZN66 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP6Q6ZN66 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP6Q6ZN66 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP6Q6ZN66 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP6Q6ZN66 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP6Q6ZN66 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GBP6Q6ZN66 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GBP6Q6ZN66 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GBP6Q6ZN66 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GBP6Q6ZN66 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GBP6Q6ZN66 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GBP6Q6ZN66 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GBP6Q6ZN66 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GBP6Q6ZN66 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GBP6Q6ZN66 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GBP6Q6ZN66 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GBP6Q6ZN66 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GBP6Q6ZN66 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GBP6Q6ZN66 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GBP6Q6ZN66 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GBP6Q6ZN66 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GBP6Q6ZN66 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GBP6Q6ZN66 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GBP6Q6ZN66 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GBP6Q6ZN66 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GBP6Q6ZN66 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GBP6Q6ZN66 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms