Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMBR1LQ6UX01 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms