Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW10

SFTA2, Surfactant-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA2Q6UW10 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTA2Q6UW10 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTA2Q6UW10 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms