Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DUX4L9Q6RFH8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms