Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLHL35Q6PF15 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms