Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW34

NEPRO, Nucleolus and neural progenitor protein, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEPROQ6NW34 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEPROQ6NW34 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEPROQ6NW34 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms