Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
APOBEC3HQ6NTF7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
APOBEC3HQ6NTF7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
APOBEC3HQ6NTF7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
APOBEC3HQ6NTF7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
APOBEC3HQ6NTF7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
APOBEC3HQ6NTF7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
APOBEC3HQ6NTF7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
APOBEC3HQ6NTF7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
APOBEC3HQ6NTF7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
APOBEC3HQ6NTF7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APOBEC3HQ6NTF7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
APOBEC3HQ6NTF7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
APOBEC3HQ6NTF7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APOBEC3HQ6NTF7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
APOBEC3HQ6NTF7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APOBEC3HQ6NTF7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APOBEC3HQ6NTF7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
APOBEC3HQ6NTF7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
APOBEC3HQ6NTF7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APOBEC3HQ6NTF7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
APOBEC3HQ6NTF7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APOBEC3HQ6NTF7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOBEC3HQ6NTF7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOBEC3HQ6NTF7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOBEC3HQ6NTF7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOBEC3HQ6NTF7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOBEC3HQ6NTF7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOBEC3HQ6NTF7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOBEC3HQ6NTF7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOBEC3HQ6NTF7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOBEC3HQ6NTF7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOBEC3HQ6NTF7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOBEC3HQ6NTF7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOBEC3HQ6NTF7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOBEC3HQ6NTF7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOBEC3HQ6NTF7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOBEC3HQ6NTF7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOBEC3HQ6NTF7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOBEC3HQ6NTF7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOBEC3HQ6NTF7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOBEC3HQ6NTF7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOBEC3HQ6NTF7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOBEC3HQ6NTF7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOBEC3HQ6NTF7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOBEC3HQ6NTF7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOBEC3HQ6NTF7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOBEC3HQ6NTF7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
APOBEC3HQ6NTF7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms