Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG16L1Q676U5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG16L1Q676U5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG16L1Q676U5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms