Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATG9BQ674R7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG9BQ674R7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG9BQ674R7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG9BQ674R7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG9BQ674R7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG9BQ674R7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG9BQ674R7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG9BQ674R7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG9BQ674R7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG9BQ674R7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG9BQ674R7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG9BQ674R7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG9BQ674R7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG9BQ674R7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG9BQ674R7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG9BQ674R7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG9BQ674R7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG9BQ674R7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG9BQ674R7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG9BQ674R7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG9BQ674R7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG9BQ674R7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG9BQ674R7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG9BQ674R7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG9BQ674R7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG9BQ674R7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG9BQ674R7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG9BQ674R7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG9BQ674R7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG9BQ674R7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG9BQ674R7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG9BQ674R7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG9BQ674R7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG9BQ674R7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG9BQ674R7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG9BQ674R7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG9BQ674R7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG9BQ674R7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG9BQ674R7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG9BQ674R7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG9BQ674R7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG9BQ674R7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG9BQ674R7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms