Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL5A1-AS1Q5SY13 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms