Protein–RNA interactions for Protein: Q5QFB9

PAPPA-AS1, Protein PAPPAS, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPPA-AS1Q5QFB9 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPPA-AS1Q5QFB9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPPA-AS1Q5QFB9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPPA-AS1Q5QFB9 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPPA-AS1Q5QFB9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPPA-AS1Q5QFB9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPPA-AS1Q5QFB9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPPA-AS1Q5QFB9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPPA-AS1Q5QFB9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPPA-AS1Q5QFB9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPPA-AS1Q5QFB9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PAPPA-AS1Q5QFB9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms