Protein–RNA interactions for Protein: Q5MNV8

FBXO47, F-box only protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO47Q5MNV8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO47Q5MNV8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO47Q5MNV8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO47Q5MNV8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO47Q5MNV8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO47Q5MNV8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO47Q5MNV8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO47Q5MNV8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO47Q5MNV8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO47Q5MNV8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO47Q5MNV8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO47Q5MNV8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO47Q5MNV8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO47Q5MNV8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO47Q5MNV8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO47Q5MNV8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO47Q5MNV8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO47Q5MNV8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO47Q5MNV8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO47Q5MNV8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO47Q5MNV8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO47Q5MNV8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO47Q5MNV8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO47Q5MNV8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO47Q5MNV8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO47Q5MNV8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO47Q5MNV8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO47Q5MNV8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO47Q5MNV8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FBXO47Q5MNV8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FBXO47Q5MNV8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FBXO47Q5MNV8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO47Q5MNV8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO47Q5MNV8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO47Q5MNV8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO47Q5MNV8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO47Q5MNV8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO47Q5MNV8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO47Q5MNV8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO47Q5MNV8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO47Q5MNV8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO47Q5MNV8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO47Q5MNV8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO47Q5MNV8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO47Q5MNV8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO47Q5MNV8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO47Q5MNV8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO47Q5MNV8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO47Q5MNV8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO47Q5MNV8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO47Q5MNV8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO47Q5MNV8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO47Q5MNV8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO47Q5MNV8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO47Q5MNV8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO47Q5MNV8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO47Q5MNV8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO47Q5MNV8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO47Q5MNV8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO47Q5MNV8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO47Q5MNV8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO47Q5MNV8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO47Q5MNV8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO47Q5MNV8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO47Q5MNV8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO47Q5MNV8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO47Q5MNV8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO47Q5MNV8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO47Q5MNV8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO47Q5MNV8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO47Q5MNV8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO47Q5MNV8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO47Q5MNV8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO47Q5MNV8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO47Q5MNV8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO47Q5MNV8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO47Q5MNV8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO47Q5MNV8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO47Q5MNV8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO47Q5MNV8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO47Q5MNV8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO47Q5MNV8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO47Q5MNV8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO47Q5MNV8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO47Q5MNV8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO47Q5MNV8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO47Q5MNV8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO47Q5MNV8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO47Q5MNV8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO47Q5MNV8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO47Q5MNV8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FBXO47Q5MNV8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FBXO47Q5MNV8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FBXO47Q5MNV8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FBXO47Q5MNV8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FBXO47Q5MNV8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FBXO47Q5MNV8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FBXO47Q5MNV8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FBXO47Q5MNV8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FBXO47Q5MNV8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms