Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FGD3Q5JSP0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FGD3Q5JSP0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms