Protein–RNA interactions for Protein: Q53T94

TAF1B, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1BQ53T94 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TAF1BQ53T94 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF1BQ53T94 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF1BQ53T94 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF1BQ53T94 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF1BQ53T94 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF1BQ53T94 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF1BQ53T94 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF1BQ53T94 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF1BQ53T94 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF1BQ53T94 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF1BQ53T94 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF1BQ53T94 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF1BQ53T94 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF1BQ53T94 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF1BQ53T94 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1BQ53T94 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1BQ53T94 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1BQ53T94 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1BQ53T94 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1BQ53T94 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1BQ53T94 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1BQ53T94 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1BQ53T94 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1BQ53T94 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1BQ53T94 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1BQ53T94 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1BQ53T94 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1BQ53T94 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1BQ53T94 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1BQ53T94 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1BQ53T94 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1BQ53T94 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1BQ53T94 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF1BQ53T94 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF1BQ53T94 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF1BQ53T94 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF1BQ53T94 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF1BQ53T94 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF1BQ53T94 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF1BQ53T94 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF1BQ53T94 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF1BQ53T94 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF1BQ53T94 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF1BQ53T94 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF1BQ53T94 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF1BQ53T94 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF1BQ53T94 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF1BQ53T94 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF1BQ53T94 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF1BQ53T94 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF1BQ53T94 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF1BQ53T94 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF1BQ53T94 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF1BQ53T94 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF1BQ53T94 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF1BQ53T94 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF1BQ53T94 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF1BQ53T94 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF1BQ53T94 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF1BQ53T94 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF1BQ53T94 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF1BQ53T94 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF1BQ53T94 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF1BQ53T94 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms