Protein–RNA interactions for Protein: Q53GD3

SLC44A4, Choline transporter-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A4Q53GD3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC44A4Q53GD3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms