Protein–RNA interactions for Protein: Q504Q3

PAN2, PAN2-PAN3 deadenylation complex catalytic subunit PAN2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN2Q504Q3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PAN2Q504Q3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PAN2Q504Q3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PAN2Q504Q3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PAN2Q504Q3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PAN2Q504Q3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PAN2Q504Q3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PAN2Q504Q3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PAN2Q504Q3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PAN2Q504Q3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAN2Q504Q3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAN2Q504Q3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAN2Q504Q3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAN2Q504Q3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAN2Q504Q3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAN2Q504Q3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PAN2Q504Q3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAN2Q504Q3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAN2Q504Q3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PAN2Q504Q3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PAN2Q504Q3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAN2Q504Q3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAN2Q504Q3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAN2Q504Q3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAN2Q504Q3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAN2Q504Q3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAN2Q504Q3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAN2Q504Q3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAN2Q504Q3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAN2Q504Q3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAN2Q504Q3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAN2Q504Q3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAN2Q504Q3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAN2Q504Q3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAN2Q504Q3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAN2Q504Q3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAN2Q504Q3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAN2Q504Q3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAN2Q504Q3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAN2Q504Q3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAN2Q504Q3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAN2Q504Q3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAN2Q504Q3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAN2Q504Q3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAN2Q504Q3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PAN2Q504Q3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAN2Q504Q3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAN2Q504Q3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAN2Q504Q3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PAN2Q504Q3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAN2Q504Q3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAN2Q504Q3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAN2Q504Q3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PAN2Q504Q3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAN2Q504Q3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAN2Q504Q3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAN2Q504Q3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAN2Q504Q3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAN2Q504Q3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAN2Q504Q3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAN2Q504Q3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAN2Q504Q3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAN2Q504Q3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAN2Q504Q3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAN2Q504Q3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PAN2Q504Q3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAN2Q504Q3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAN2Q504Q3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PAN2Q504Q3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAN2Q504Q3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAN2Q504Q3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAN2Q504Q3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAN2Q504Q3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PAN2Q504Q3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAN2Q504Q3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAN2Q504Q3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAN2Q504Q3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAN2Q504Q3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAN2Q504Q3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAN2Q504Q3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAN2Q504Q3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAN2Q504Q3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAN2Q504Q3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PAN2Q504Q3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAN2Q504Q3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAN2Q504Q3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAN2Q504Q3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAN2Q504Q3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAN2Q504Q3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAN2Q504Q3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAN2Q504Q3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAN2Q504Q3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAN2Q504Q3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAN2Q504Q3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAN2Q504Q3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAN2Q504Q3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAN2Q504Q3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAN2Q504Q3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAN2Q504Q3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAN2Q504Q3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms