Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FNDC1Q4ZHG4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FNDC1Q4ZHG4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FNDC1Q4ZHG4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FNDC1Q4ZHG4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FNDC1Q4ZHG4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FNDC1Q4ZHG4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FNDC1Q4ZHG4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FNDC1Q4ZHG4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FNDC1Q4ZHG4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FNDC1Q4ZHG4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
FNDC1Q4ZHG4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FNDC1Q4ZHG4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FNDC1Q4ZHG4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FNDC1Q4ZHG4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FNDC1Q4ZHG4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FNDC1Q4ZHG4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FNDC1Q4ZHG4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FNDC1Q4ZHG4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FNDC1Q4ZHG4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FNDC1Q4ZHG4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FNDC1Q4ZHG4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FNDC1Q4ZHG4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FNDC1Q4ZHG4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FNDC1Q4ZHG4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FNDC1Q4ZHG4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FNDC1Q4ZHG4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FNDC1Q4ZHG4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FNDC1Q4ZHG4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FNDC1Q4ZHG4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FNDC1Q4ZHG4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FNDC1Q4ZHG4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FNDC1Q4ZHG4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FNDC1Q4ZHG4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FNDC1Q4ZHG4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FNDC1Q4ZHG4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FNDC1Q4ZHG4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FNDC1Q4ZHG4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FNDC1Q4ZHG4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FNDC1Q4ZHG4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FNDC1Q4ZHG4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FNDC1Q4ZHG4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FNDC1Q4ZHG4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FNDC1Q4ZHG4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FNDC1Q4ZHG4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FNDC1Q4ZHG4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FNDC1Q4ZHG4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FNDC1Q4ZHG4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FNDC1Q4ZHG4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FNDC1Q4ZHG4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FNDC1Q4ZHG4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FNDC1Q4ZHG4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FNDC1Q4ZHG4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FNDC1Q4ZHG4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FNDC1Q4ZHG4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FNDC1Q4ZHG4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FNDC1Q4ZHG4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FNDC1Q4ZHG4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FNDC1Q4ZHG4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FNDC1Q4ZHG4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FNDC1Q4ZHG4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FNDC1Q4ZHG4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FNDC1Q4ZHG4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FNDC1Q4ZHG4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms