Protein–RNA interactions for Protein: Q49MG5

MAP9, Microtubule-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP9Q49MG5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MAP9Q49MG5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MAP9Q49MG5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MAP9Q49MG5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MAP9Q49MG5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MAP9Q49MG5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MAP9Q49MG5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MAP9Q49MG5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MAP9Q49MG5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MAP9Q49MG5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MAP9Q49MG5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAP9Q49MG5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAP9Q49MG5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAP9Q49MG5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAP9Q49MG5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAP9Q49MG5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAP9Q49MG5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAP9Q49MG5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAP9Q49MG5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAP9Q49MG5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAP9Q49MG5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAP9Q49MG5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAP9Q49MG5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAP9Q49MG5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAP9Q49MG5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAP9Q49MG5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAP9Q49MG5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAP9Q49MG5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAP9Q49MG5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAP9Q49MG5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAP9Q49MG5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MAP9Q49MG5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MAP9Q49MG5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MAP9Q49MG5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MAP9Q49MG5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MAP9Q49MG5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MAP9Q49MG5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MAP9Q49MG5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MAP9Q49MG5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MAP9Q49MG5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MAP9Q49MG5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MAP9Q49MG5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MAP9Q49MG5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MAP9Q49MG5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MAP9Q49MG5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MAP9Q49MG5 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MAP9Q49MG5 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MAP9Q49MG5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MAP9Q49MG5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MAP9Q49MG5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MAP9Q49MG5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAP9Q49MG5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAP9Q49MG5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAP9Q49MG5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAP9Q49MG5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAP9Q49MG5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAP9Q49MG5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAP9Q49MG5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAP9Q49MG5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAP9Q49MG5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAP9Q49MG5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAP9Q49MG5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAP9Q49MG5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAP9Q49MG5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAP9Q49MG5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAP9Q49MG5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAP9Q49MG5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAP9Q49MG5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAP9Q49MG5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAP9Q49MG5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAP9Q49MG5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAP9Q49MG5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAP9Q49MG5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAP9Q49MG5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAP9Q49MG5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAP9Q49MG5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAP9Q49MG5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAP9Q49MG5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAP9Q49MG5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAP9Q49MG5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAP9Q49MG5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAP9Q49MG5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAP9Q49MG5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAP9Q49MG5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAP9Q49MG5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAP9Q49MG5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAP9Q49MG5 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAP9Q49MG5 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAP9Q49MG5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAP9Q49MG5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAP9Q49MG5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAP9Q49MG5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAP9Q49MG5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAP9Q49MG5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAP9Q49MG5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAP9Q49MG5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAP9Q49MG5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MAP9Q49MG5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAP9Q49MG5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAP9Q49MG5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms